Woordenlijst
Oxidatie (methionine)
Methionineoxidatie voegt 16 Da toe aan een peptide en is de vaakst voorkomende modificatie bij opslag. Hoe ze ontstaat, zichtbaar wordt en wordt beperkt.
Methionineoxidatie is de omzetting van de thioetherzwavel in een methioninezijketen naar een sulfoxide, waarbij één zuurstofatoom en dus 16 Da aan de peptidemassa wordt toegevoegd. Verdere oxidatie tot het sulfon voegt nog eens 16 Da toe, maar verloopt veel langzamer. Tryptofaan en cysteïne oxideren via verwante routes, maar methionine is onder typische opslagcondities het meest reactieve residu.
Waarom methionineoxidatie ertoe doet in peptideonderzoek
Het is de vaakst waargenomen chemische verandering in opgeslagen peptiden, en er is geen drastische mishandeling voor nodig: opgeloste zuurstof, sporen van metaalionen zoals ijzer of koper, licht en een verhoogde pH volstaan. De gevolgen zijn zowel conformationeel als chemisch, omdat een sulfoxide duidelijk polairder is dan een thioether, zodat een geoxideerd residu op of nabij een bindingsoppervlak de receptorpotentie aanzienlijk kan verminderen terwijl de sequentie verder intact blijft.
Detectie is eenvoudig als u ernaar zoekt: een satellietpiek bij +16 in massaspectrometrie en een eerder eluerende schouder in reversed-phase-HPLC, omdat de geoxideerde vorm minder lipofiel is. De beperking is prozaïsch — houd het materiaal gevriesdroogd en koud, sluit licht uit, vermijd contact met metaal en minimaliseer de lucht in de kopruimte. Zie de opslaggids en de leeswijzer voor COA's.
Gerelateerde termen
afbraak · stabiliteit · disulfidebrug