Amminoacido

Un amminoacido è l'unità monomerica di ogni peptide: un carbonio alfa centrale che porta un gruppo amminico, un gruppo carbossilico, un idrogeno e una catena laterale variabile (il gruppo R) che conferisce al residuo la sua chimica. Venti L-amminoacidi proteinogenici costituiscono le sequenze native. I peptidi di ricerca aggiungono abitualmente anche residui non standard — D-amminoacidi, Aib (acido 2-amminoisobutirrico) e altri analoghi non naturali — inseriti proprio per resistere alla scissione enzimatica.

Le catene laterali determinano la manipolazione

La chimica delle catene laterali predice gran parte del comportamento pratico in laboratorio. Metionina e cisteina si ossidano; asparagina e glutammina vanno incontro a deamidazione; coppie di cisteine formano ponti disolfuro; e l'equilibrio tra residui acidi (Asp, Glu) e basici (Lys, Arg, His) determina il punto isoelettrico, che a sua volta governa la solubilità a un dato pH. Aib occupa la posizione 2 della semaglutide e le posizioni 2 e 13 della tirzepatide proprio perché impedisce la scissione da parte della DPP-4: una scelta di design strutturale, non un additivo di formulazione.

Perché è importante

Le sequenze si scrivono dall'N-terminale al C-terminale in codice a una o tre lettere, e il risultato di massa di un certificato è interpretabile solo rispetto alla massa teorica calcolata da quell'elenco di residui. La sostituzione di un solo residuo sposta il peso molecolare di qualche dalton, quanto basta perché la MS lo rilevi.

Termini correlati

peptide · legame peptidico · ossidazione (metionina). Si vedano come leggere una sequenza peptidica e Tirzepatide.