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Guias de moléculas

O que é o SS-31? Estrutura do elamipretide, mecanismo via cardiolipina e panorama da investigação

O que é o SS-31? O tetrapéptido de Szeto–Schiller que se liga à cardiolipina da membrana mitocondrial interna — estrutura, mecanismo e registo de ensaios.

6 minutos de leituraDestinado a responsáveis de compras de laboratório e investigadores

O SS-31 é um péptido sintético de quatro resíduos, D-Arg-Dmt-Lys-Phe-NH2, concebido para se acumular na membrana mitocondrial interna e ligar-se à cardiolipina — o fosfolípido característico dessa membrana. Ao contrário dos péptidos derivados da mitocôndria, não está codificado em nenhum ponto do genoma; é uma molécula modificada da série aromático-catiónica de Szeto–Schiller, e a sua propriedade definidora é o direcionamento e não o agonismo de recetores. Também catalogado como elamipretide, MTP-131 e Bendavia, é a molécula clinicamente mais avançada da secção mitocondrial deste catálogo, com um programa de ensaios de registo por detrás.

A Peptide Medix EU fornece SS-31 (Elamipretide) sob a forma de pó liofilizado em frascos de 10 mg, 30 mg e 50 mg, na gama de péptidos mitocondriais.

O que é o SS-31?

O SS-31 é um tetrapéptido com um padrão alternado de resíduos catiónicos e aromáticos: D-arginina, 2',6'-dimetil-L-tirosina (Dmt), lisina e fenilalanina, terminando numa amida C-terminal. Os seus identificadores são CAS 736992-21-5, fórmula molecular C32H49N9O5 e massa molecular 639,80 g/mol.

Cada elemento estrutural tem uma função. A D-arginina na posição 1 resiste à clivagem pelas aminopeptidases; a amida C-terminal elimina o carboxilato livre e, com ele, o substrato das carboxipeptidases. A carga líquida de +3 promove a acumulação no espaço da matriz mitocondrial, enquanto as duas cadeias laterais aromáticas conferem à molécula carácter lipofílico suficiente para se repartir numa membrana. O resíduo Dmt não é de todo um aminoácido proteinogénico — é um derivado sintético da tirosina que aumenta a aromaticidade e a estabilidade metabólica. O resultado é um péptido que se concentra nas mitocôndrias por físico-química e não por ligação a um recetor ou por uma sequência de importação.

Origem e estrutura

A série de Szeto–Schiller resultou do trabalho de Hazel Szeto e Peter Schiller no início da década de 2000. O ponto de partida não estava relacionado: análogos de péptidos opioides construídos em torno do Dmt, a partir dos quais o grupo notou que certas sequências catiónico-aromáticas se concentravam nas mitocôndrias vários milhares de vezes acima da sua concentração extracelular. Membros posteriores da série, entre eles o SS-31, foram concebidos para manter o direcionamento mitocondrial eliminando a atividade nos recetores opioides, e o SS-31 é descrito como desprovido de atividade opioide relevante nas concentrações utilizadas no trabalho mitocondrial.

Uma distinção importante em relação a estratégias anteriores de direcionamento mitocondrial: a captação do SS-31 não depende do potencial de membrana. Os compostos conjugados com trifenilfosfónio acumulam-se porque a matriz é eletricamente negativa, o que significa que falham precisamente nas mitocôndrias despolarizadas e disfuncionais que se pretende atingir. A acumulação do SS-31 é independente do potencial, o que constitui o argumento prático para a sua utilização em modelos de disfunção mitocondrial.

Como se pensa que o SS-31 atua

O mecanismo descrito na literatura centra-se na cardiolipina, um fosfolípido de quatro caudas encontrado quase exclusivamente na membrana mitocondrial interna, onde organiza as pregas das cristas e mantém os complexos da cadeia respiratória em arranjos de supercomplexos. O SS-31 liga-se à cardiolipina através de uma interação combinada eletrostática e hidrofóbica.

São descritas duas consequências a jusante. Primeiro, a cardiolipina ancora normalmente o citocromo c à membrana; quando essa interação se altera, o citocromo c adquire atividade de peroxidase, oxida a cardiolipina e inicia a cascata de libertação que conduz à apoptose. A ligação do SS-31 é descrita como estabilizando a associação citocromo c–cardiolipina na sua configuração de transportador de eletrões e suprimindo o comportamento de peroxidase. Segundo, a arquitetura das cristas e a organização dos supercomplexos são descritas como melhorando em modelos em que estavam desorganizadas, com alterações associadas da eficiência respiratória e redução da fuga de eletrões para espécies reativas de oxigénio.

O enquadramento relevante para o desenho dos estudos é que o SS-31 não é um antioxidante no sentido de captador. A sua ação descrita é estrutural — restaurar uma característica organizacional de uma membrana para que sejam produzidas menos espécies reativas — e não neutralizar espécies depois de formadas. Também não tem recetor identificado, porque não precisa de um.

O que a investigação examinou

Isquemia–reperfusão e modelos cardíacos

A maior literatura pré-clínica abrange modelos de roedores e de animais de grande porte de lesão por isquemia e reperfusão cardíaca, descrevendo reduções da dimensão do enfarte e preservação da respiração mitocondrial. Os modelos de isquemia–reperfusão renal apresentam um corpo de trabalho paralelo.

Miopatia mitocondrial primária

O esforço central do programa clínico incidiu na miopatia mitocondrial primária, em que um ensaio de fase 3 comunicou que o estudo não atingiu o seu parâmetro de avaliação funcional primário, apesar de sinais em fases anteriores. É um resultado instrutivo: um mecanismo com bom desempenho pré-clínico não se traduziu de forma limpa num resultado clínico funcional.

Síndrome de Barth

A síndrome de Barth é causada por mutações na tafazina, a enzima que remodela a cardiolipina, o que faz dela a indicação mecanisticamente mais direta para uma molécula que se liga à cardiolipina. Foram comunicados um ensaio cruzado e a respetiva extensão aberta, e a avaliação regulamentar do elamipretide para esta doença rara tem sido um processo em evolução nos últimos anos. Qualquer que seja o seu estatuto atual, um medicamento aprovado não é a mesma substância que o material de grau de investigação, e os dois nunca devem ser confundidos.

Ensaios na degenerescência macular relacionada com a idade seca e na atrofia geográfica examinaram a função do epitélio pigmentado da retina, uma aplicação motivada pela elevada densidade mitocondrial desse tecido.

Envelhecimento e músculo esquelético

Estudos em roedores e em músculo humano ex vivo examinaram a respiração mitocondrial, a produção de ATP e a resistência à fadiga em tecido envelhecido, descrevendo melhorias nas medidas respiratórias. Trata-se de trabalho pré-clínico.

Formas e formatos que fornecemos

Três formatos cobrem o intervalo entre séries in vitro à escala de placa e trabalho pré-clínico de maior dimensão. A comparação com a alternativa codificada pela mitocôndria é apresentada em MOTS-c vs SS-31.

Reconstituição e armazenamento em contexto laboratorial

O SS-31 é livremente solúvel em água e em água bacteriostática — um péptido curto e fortemente catiónico é tão fácil de dissolver quanto um péptido pode ser. O solvente é adicionado pela parede do frasco e o frasco é rodado em vez de agitado.

A aritmética é um cálculo laboratorial: um frasco de 30 mg preparado com 3 mL de diluente dá 10 mg/mL, ou 10 000 mcg/mL, pelo que 0,1 mL — a marca de 10 unidades numa seringa U-100 — contém 1000 mcg. A 639,80 g/mol, 1 mg corresponde a aproximadamente 1,56 µmol, um valor útil porque a maior parte do trabalho in vitro publicado com esta molécula é expressa em termos molares e não mássicos. Os pormenores do método constam do nosso guia de reconstituição.

Os frascos liofilizados são mantidos a −20 °C, selados e protegidos da luz e da humidade. O material reconstituído é mantido a 2–8 °C dentro da janela do estudo, ou dividido em alíquotas e congelado para trabalho mais prolongado. O resíduo Dmt é um fenol e é sensível à oxidação, pelo que a proteção contra a luz e o ar é importante aqui, tal como nos péptidos que contêm tirosina em geral. As práticas mais gerais constam de como armazenar péptidos.

Pureza, COA e como o ler

A confirmação da identidade é um resultado de espectrometria de massa correspondente a 639,80 g/mol. Para esta sequência, a estereoquímica é a especificação que um certificado de rotina tem menos probabilidade de comprovar: a arginina tem de ser o enantiómero D, e um espectro de massa não consegue distinguir D de L. Quando a pureza enantiomérica é relevante para a experiência, a HPLC quiral ou a análise de aminoácidos é o teste pertinente, e a sua presença num certificado é um sinal genuíno de qualidade. Para além disso, aplicam-se as entradas habituais — pureza como área do pico principal, contraião (a purificação em fase reversa deixa normalmente um sal de TFA), número de lote e data de fabrico. O nosso guia para ler um certificado de análise de péptidos aborda cada secção.

Estatuto regulamentar

O elamipretide tem sido objeto de um programa clínico substancial e de avaliação regulamentar para uma doença mitocondrial rara, e esse estatuto tem evoluído nos últimos anos. Há dois pontos que se mantêm, independentemente disso. O material de grau de investigação aqui fornecido não é um produto farmacêutico, não foi fabricado segundo normas farmacêuticas e não é equivalente a nenhum medicamento aprovado ou experimental com o mesmo nome molecular. Não existe qualquer utilização aprovada para ele, sob nenhuma forma.

Os membros deste domínio codificados no genoma são o MOTS-c e a Humanin, ambos péptidos derivados da mitocôndria que atuam por sinalização e não por direcionamento membranar. Do lado dos cofatores, o NAD+ atua sobre a capacidade redox e não sobre a estrutura da membrana. Uma orientação mais ampla consta do nosso panorama sobre péptidos para investigação em energia e mitocôndrias.

Perguntas

O que é o SS-31, do ponto de vista químico?

Um tetrapéptido sintético, D-Arg-Dmt-Lys-Phe-NH2, de 639,80 g/mol, construído sobre um padrão alternado catiónico–aromático. O Dmt é a 2',6'-dimetil-L-tirosina, um derivado sintético da tirosina e não um aminoácido proteinogénico. Está também catalogado como elamipretide, MTP-131 e Bendavia.

Como chega o SS-31 às mitocôndrias sem um recetor?

Por físico-química. A sua carga líquida de +3 promove a acumulação no espaço da matriz, enquanto duas cadeias laterais aromáticas lhe permitem repartir-se na membrana. Crucialmente, essa captação é independente do potencial de membrana, ao contrário dos compostos conjugados com trifenilfosfónio, que falham nas mitocôndrias despolarizadas que se pretende atingir.

O que faz efetivamente a ligação à cardiolipina?

A cardiolipina organiza as pregas das cristas e ancora o citocromo c. A ligação do SS-31 é descrita como estabilizando a associação citocromo c–cardiolipina na sua configuração de transportador de eletrões, suprimindo o comportamento de peroxidase que inicia a libertação apoptótica, e como melhorando a arquitetura das cristas e a organização dos supercomplexos em modelos desorganizados.

O SS-31 é um antioxidante?

Não no sentido de captador. A sua ação descrita é estrutural — restaurar uma característica organizacional da membrana interna para que sejam produzidas menos espécies reativas — e não neutralizar espécies depois de formadas. Essa distinção é importante ao desenhar as leituras e escolher os comparadores.

O que mostrou o programa clínico?

Resultados mistos. Um ensaio de fase 3 na miopatia mitocondrial primária não atingiu o seu parâmetro de avaliação funcional primário, apesar de sinais em fases anteriores. O trabalho na síndrome de Barth — causada por mutações na enzima de remodelação da cardiolipina tafazina e, por isso, a indicação mecanisticamente mais direta — tem sido objeto de uma avaliação regulamentar em evolução.

Qual é a especificação mais difícil de verificar num certificado de SS-31?

A estereoquímica. A arginina tem de ser o enantiómero D, e a espectrometria de massa não consegue distinguir D de L. Quando a pureza enantiomérica é relevante, a HPLC quiral ou a análise de aminoácidos é o teste pertinente, e a sua presença num certificado é um sinal genuíno de qualidade para além da habitual percentagem de pureza.

Em que difere o SS-31 do MOTS-c e da humanina?

Na origem e no modo de ação. O MOTS-c e a humanina estão codificados no ADN mitocondrial e atuam como péptidos sinalizadores sobre vias citosólicas e nucleares. O SS-31 é uma molécula modificada que não está codificada em lado nenhum; atua concentrando-se na membrana interna e ligando-se a um fosfolípido.