Słownik
Masa cząsteczkowa (Da)
Masa cząsteczkowa w daltonach łączy miligramy z molami i pozwala potwierdzić tożsamość metodą MS. Masa monoizotopowa a masa średnia.
Masa cząsteczkowa to masa cząsteczki wyrażona w daltonach (Da), przy czym jeden dalton to jedna dwunasta masy atomu węgla-12 i liczbowo odpowiada jednemu gramowi na mol. Peptydy badawcze mieszczą się zwykle w zakresie od około 300 Da dla tripeptydu, takiego jak GHK-Cu, do mniej więcej 4000–5000 Da dla większych analogów inkretyn; semaglutide ma około 4114 Da.
Dlaczego masa cząsteczkowa ma znaczenie w badaniach peptydów
Dominują dwa zastosowania. Masa cząsteczkowa przelicza masę na liczność substancji, więc bez niej nie da się obliczyć molowości: liczba moli równa się masie w gramach podzielonej przez masę cząsteczkową, a fiolka 5 mg peptydu o masie 4114 Da zawiera około 1.22 µmol. Stanowi też punkt odniesienia dla potwierdzenia tożsamości, ponieważ wynik spektrometrii mas w certyfikacie analizy ocenia się według tego, jak blisko masa zmierzona odpowiada obliczonej.
Dwie subtelności bywają źródłem pomyłek. Masa średnia, ważona po naturalnych izotopach, różni się od masy monoizotopowej, obliczanej z najobficiej występującego izotopu każdego pierwiastka; poniżej około 2000 Da mogą się różnić o dalton lub więcej, a COA powinien podawać, którą z nich raportuje. Ponadto sól TFA lub koniugat z PEG waży więcej niż wolny peptyd, więc deklarowane miligramy nie są w całości peptydem. Przykłady omówiono w przewodniku po masie cząsteczkowej i molach.
Powiązane terminy
mikrogramy a miligramy · kalkulator molowości