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Guias de moléculas

O que é o IGF-1 DES? Estrutura, mecanismo IGF-1R e panorama da investigação

O que é o IGF-1 DES? A truncagem natural do IGF-1 com 67 resíduos que escapa às proteínas de ligação ao IGF — estrutura, mecanismo, investigação e verificação do COA.

6 minutos de leituraDestinado a responsáveis de compras de laboratório e investigadores

O IGF-1 DES é o fator de crescimento semelhante à insulina 1 humano nativo sem os seus três primeiros aminoácidos — Gly-Pro-Glu —, o que resulta numa proteína de 67 resíduos com 7371,30 g/mol. Essa única deleção remove o resíduo de glutamato de que as proteínas de ligação ao IGF dependem para o contacto de alta afinidade, pelo que a molécula truncada circula e atua em grande medida sem o efeito tampão do sistema IGFBP, mantendo plena atividade agonista no recetor do IGF-1. Ao contrário da maioria dos análogos manipulados, o IGF-1 DES (1-3) não é uma invenção de laboratório: foi isolado pela primeira vez a partir de colostro bovino e de tecido cerebral, e é gerado in vivo por uma protease N-terminal específica.

A Peptide Medix EU fornece o IGF-1 DES (1-3) como pó liofilizado em frascos de 0,1 mg e 1 mg, na gama de péptidos IGF e musculares. Fornecido exclusivamente para fins de investigação laboratorial.

O que é o IGF-1 DES?

O nome é descritivo: «des» é o prefixo químico que designa um grupo eliminado, e (1-3) identifica os resíduos em falta. O IGF-1 completo é uma proteína de cadeia única com 70 resíduos, com um enrolamento semelhante ao da pró-insulina e três pontes dissulfureto, produzida sobretudo pelos hepatócitos sob controlo da hormona de crescimento. O IGF-1 DES é essa mesma cadeia a começar no resíduo 4, pelo que a superfície de ligação ao recetor, o padrão de pontes dissulfureto e o enrolamento global se mantêm inalterados; apenas desaparece o tripéptido N-terminal flexível.

Os identificadores de catálogo são o CAS 112603-35-7 e uma massa molecular de 7371,30 g/mol, cerca de 278 Da inferior à do IGF-1 nativo. Por se tratar de uma proteína de 67 resíduos, é produzido por expressão recombinante e não por síntese passo a passo, sendo fornecido como pó liofilizado.

Origem e estrutura

O IGF-1 DES ocupa uma posição invulgar: é simultaneamente um péptido de ocorrência natural e uma ferramenta de investigação desenhada. Foi identificado no colostro bovino no final da década de 1980 e, posteriormente, no útero de porco e em tecido cerebral de mamíferos, e foi descrita uma protease ácida que cliva o tripéptido Gly-Pro-Glu do IGF-1. Essa reação liberta também o próprio GPE (glipromato), um tripéptido com uma pequena literatura própria sobre neuroproteção, independente do recetor do IGF-1 — pelo que a clivagem produz dois fragmentos biologicamente interessantes, e não uma molécula ativa e um produto residual.

A consequência funcional da deleção limita-se ao contacto com as proteínas de ligação. O glutamato 3 estabelece um contacto eletrostático com a superfície das IGFBP; a sua remoção foi descrita como reduzindo a afinidade para as proteínas de ligação em uma a duas ordens de grandeza, consoante a IGFBP medida. A afinidade para o recetor mantém-se essencialmente, e em alguns estudos de ligação foi descrito que o IGF-1 DES se liga ao IGF-1R de forma ligeiramente mais forte do que a proteína completa.

Como se pensa que o IGF-1 DES atua

O mecanismo imediato é um agonismo simples no IGF-1R, um recetor tirosina cinase α2β2. A ligação do ligando induz a autofosforilação da subunidade β, o recrutamento de adaptadores do substrato do recetor da insulina e a sinalização através de PI3K/Akt/mTOR — o ramo associado na literatura a leituras de síntese proteica e sobrevivência celular — e de Ras/MEK/ERK, associado à proliferação.

O que distingue experimentalmente o DES do IGF-1 nativo não é o sinal, mas a disponibilidade. Num sistema que contenha proteínas de ligação ao IGF — meio com soro, meio condicionado de células secretoras de IGFBP ou tecido intacto —, a maior parte do IGF-1 nativo adicionado é captada e retida. A mesma quantidade molar de IGF-1 DES permanece em grande parte livre. As diferenças de potência aparente descritas nesses sistemas, de várias vezes até cerca de dez vezes, acompanham o teor de IGFBP do modelo e não qualquer propriedade intrínseca da molécula: num ensaio sem proteínas de ligação, o DES e o IGF-1 nativo comportam-se de forma semelhante.

Um segundo aspeto, mais subtil, diz respeito aos tecidos com proteólise ativa das IGFBP. Onde as proteases libertam localmente o IGF-1 das suas proteínas de ligação, a vantagem de um análogo que escapa às proteínas de ligação diminui. Esta é uma das razões pelas quais os investigadores escolhem deliberadamente entre o DES e o análogo baseado em substituição, em vez de os tratarem como equivalentes.

O que a investigação examinou

Potência em cultura celular e dependência das IGFBP

O conjunto de trabalhos mais bem caracterizado compara o DES com o IGF-1 nativo em sistemas celulares com diferentes teores de proteínas de ligação. Culturas de fibroblastos, mioblastos e osteoblastos foram utilizadas para demonstrar que a diferença de potência aumenta à medida que sobem os níveis de IGFBP — a observação que estabeleceu o mecanismo. Trata-se de estudos in vitro com leituras definidas, como a incorporação de timidina e a fosforilação do recetor.

Modelos de músculo esquelético e de células satélite

Trabalhos com C2C12 e mioblastos primários utilizaram o IGF-1 DES para estudar a sinalização de proliferação e diferenciação em situações em que as IGFBP-5 e IGFBP-6 secretadas, de outro modo, confundiriam a interpretação. Os resultados situam-se ao nível celular e não constituem evidência sobre resultados no organismo inteiro.

Funções neurais e origem no colostro

Por a molécula ocorrer naturalmente em tecido cerebral, vários estudos em roedores examinaram o DES(1-3) IGF-1 em modelos de sobrevivência e lesão neuronal, frequentemente em conjunto com o tripéptido GPE libertado. Esta literatura é pré-clínica e exploratória.

Trabalhos comparativos com análogos

O IGF-1 DES é habitualmente estudado em comparação com o IGF-1 LR3, que atinge o mesmo objetivo relativamente às proteínas de ligação substituindo o resíduo na posição 3 por arginina e acrescentando uma extensão N-terminal. Os dois diferem em tamanho, ponto isoelétrico, depuração descrita e comportamento em tecido proteoliticamente ativo; os critérios práticos de seleção são apresentados na nossa comparação IGF-1 LR3 vs IGF-1 DES, e o enquadramento sobre a lógica de engenharia encontra-se em «porque existem estas modificações».

Formas e tamanhos fornecidos

O frasco de 0,1 mg cobre trabalho de cultura à escala de placa, em que as concentrações de trabalho se situam na gama dos nanogramas por mililitro; o frasco de 1 mg é a unidade prática para uma série mais longa que deva decorrer com um único lote. As verificações do fornecedor são abordadas no nosso guia de compra do IGF-1 DES.

Reconstituição e armazenamento em contexto laboratorial

O IGF-1 DES é manuseado como uma proteína recombinante e não como um pequeno péptido sintético. A solubilidade a pH neutro é limitada, pelo que é normalmente reconstituído num ácido diluído — ácido clorídrico 10 mM ou ácido acético a 0,1% são as convenções na literatura de produto publicada — e depois diluído no tampão ou meio do ensaio. Adicionar tampão neutro diretamente ao pó liofilizado compactado arrisca uma dissolução parcial e agregação, que se manifestam como atividade inconsistente e não como turvação visível.

O cálculo de concentração é simples: um frasco de 1 mg levado a 1 mL dá 1 mg/mL, ou seja, 1000 mcg/mL, e 0,1 mL dessa solução-mãe contém 100 mcg. As soluções de trabalho situam-se tipicamente várias diluições abaixo, ponto em que a adsorção às paredes dos tubos se torna o principal mecanismo de perda — a contramedida padrão é uma proteína transportadora, como albumina sérica bovina a 0,1%. O procedimento geral consta do nosso guia de reconstituição.

Os frascos liofilizados selados são conservados a −20 °C ou menos, protegidos da luz e da humidade. A solução-mãe reconstituída é imediatamente dividida em alíquotas e congelada, porque os ciclos repetidos de congelação-descongelação são a principal ameaça prática a uma proteína de 7 kDa com pontes dissulfureto. As boas práticas gerais de manuseamento constam de «como armazenar péptidos».

Pureza, COA e como interpretá-lo

Para um produto recombinante, o certificado deve fazer mais do que indicar uma percentagem de pureza. O resultado de espectrometria de massa é aqui a verificação de identidade mais importante: uma massa observada próxima de 7371 g/mol confirma o análogo truncado, ao passo que um valor próximo de 7649 g/mol indicaria IGF-1 completo e um valor acima de 9000 g/mol indicaria o análogo LR3. Como os três produtos parecem semelhantes num rótulo e muito diferentes num espetro, esta linha merece leitura atenta. Uma pista de SDS-PAGE acrescenta informação que um traçado de fase reversa pode ocultar, em particular dímeros e espécies clivadas, e o teor de endotoxinas é relevante sempre que o material se destine a cultura celular. O nosso guia de leitura do certificado de análise de péptidos percorre cada secção.

Estatuto regulamentar

O IGF-1 DES (1-3) não tem autorização de introdução no mercado como medicamento em nenhum país. O IGF-1 humano recombinante (mecasermin) é um medicamento sujeito a receita médica aprovado para uma perturbação rara do crescimento, mas trata-se da molécula completa de 70 resíduos, uma substância diferente do análogo truncado aqui fornecido. O material deste site destina-se a pessoal de laboratório qualificado e não é um suplemento nem um medicamento. O IGF-1 e os seus análogos são proibidos no desporto ao abrigo das regras antidopagem.

Os comparadores mais próximos são o IGF-1 LR3, o análogo por substituição e extensão, e o MGF, o péptido do domínio E da variante de splicing IGF-1 Ec — uma molécula totalmente diferente, que não atua no IGF-1R e responde a uma pergunta experimental diferente.

Perguntas

O que significa DES (1-3) em IGF-1 DES?

«Des» é o prefixo químico que designa um grupo eliminado, e (1-3) identifica os resíduos em falta: o tripéptido N-terminal Gly-Pro-Glu. A cadeia remanescente de 67 resíduos mantém o enrolamento nativo, o padrão de pontes dissulfureto e a superfície de ligação ao recetor do IGF-1 completo.

O IGF-1 DES é uma molécula natural ou manipulada?

Ambas. Foi isolado pela primeira vez a partir de colostro bovino e encontrado posteriormente no útero de porco e em tecido cerebral de mamíferos, e foi descrita uma protease ácida que cliva o tripéptido Gly-Pro-Glu do IGF-1. É também produzido por via recombinante como reagente de investigação.

Porque é que o IGF-1 DES é descrito como mais potente do que o IGF-1?

Devido à disponibilidade, não à afinidade para o recetor. A remoção do Glu3 reduz a afinidade para as proteínas de ligação ao IGF em uma a duas ordens de grandeza, pelo que uma maior parte do material adicionado permanece livre. A diferença de potência descrita aumenta à medida que sobe o teor de IGFBP do sistema-modelo e desaparece em grande parte nos ensaios sem proteínas de ligação.

O que é o GPE e porque surge associado ao IGF-1 DES?

O GPE, ou glipromato, é o tripéptido Gly-Pro-Glu libertado quando o IGF-1 é clivado em DES(1-3). Tem uma pequena literatura própria sobre neuroproteção, independente do recetor do IGF-1, pelo que a reação de clivagem produz duas moléculas de interesse para a investigação, e não uma.

Como se compara o IGF-1 DES com o IGF-1 LR3?

Resolvem o mesmo problema de formas opostas: o DES elimina o resíduo de contacto com as proteínas de ligação, o LR3 substitui-o e acrescenta uma extensão N-terminal de 13 resíduos. Diferem na massa molecular, no ponto isoelétrico, na depuração descrita e no comportamento em tecido com proteólise ativa das IGFBP.

Que massa deve constar do certificado de análise?

Aproximadamente 7371 g/mol, CAS 112603-35-7. Este valor distingue o análogo truncado do IGF-1 completo, próximo de 7649 g/mol, e do IGF-1 LR3, acima de 9000 g/mol, o que faz da linha de espectrometria de massa a verificação de identidade mais útil do certificado.

Como se armazena e reconstitui o IGF-1 DES?

Frascos liofilizados a −20 °C ou menos, selados e protegidos da luz e da humidade. A reconstituição utiliza normalmente um ácido diluído, como HCl 10 mM ou ácido acético a 0,1%, antes da diluição em tampão ou meio, e as soluções de trabalho diluídas incluem habitualmente uma proteína transportadora, como BSA a 0,1%, para limitar as perdas por adsorção.