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Guide alle molecole

Che cos'è ACE-031? Struttura, meccanismo e panoramica della ricerca su ActRIIB-Fc

ACE-031: la trappola solubile ActRIIB-Fc per la miostatina. Costrutto, meccanismo, perché lo sviluppo clinico si fermò nel 2013 e come leggerne il COA.

6 minuti di letturaScritto per acquirenti di laboratorio e ricercatori

ACE-031 è un recettore esca solubile: il dominio extracellulare di legame del ligando del recettore dell'activina umano di tipo IIB fuso alla regione Fc dell'IgG1 umana, espresso come omodimero legato da ponti disolfuro. Agisce intercettando la miostatina e i ligandi correlati della superfamiglia del TGF-β nello spazio extracellulare prima che possano raggiungere il recettore di membrana. Sviluppato da Acceleron Pharma e catalogato anche come ActRIIB-Fc o ramatercept, è giunto a studi clinici di fase 2 ed è stato interrotto nel 2013: una storia essenziale per interpretare correttamente la molecola nella letteratura.

Peptide Medix EU fornisce ACE-031 come proteina ricombinante liofilizzata in flaconcino da 1 mg, all'interno della gamma di peptidi IGF e per il muscolo. Fornito esclusivamente per ricerca di laboratorio.

Che cos'è ACE-031?

ACE-031 è una proteina di fusione, non un peptide. Lo definiscono due componenti. La prima è il dominio extracellulare di ActRIIB, uno dei due recettori dell'activina di tipo II che si trovano al vertice della cascata di segnalazione SMAD2/3 nel muscolo scheletrico. La seconda è il frammento Fc dell'IgG1 umana, un modulo standard di ingegneria proteica che conferisce contemporaneamente due proprietà: induce la dimerizzazione, dotando il costrutto di due bracci di legame del ligando, e sfrutta la via di riciclo del recettore Fc neonatale, che prolunga la persistenza in circolo da ore a giorni.

Il risultato è una molecola con la specificità di legame di un recettore e la farmacocinetica di un anticorpo, priva di qualsiasi capacità di segnalazione propria: il classico disegno a trappola per ligandi. Essendo una glicoproteina dimerica, migra ben oltre i 70 kDa in SDS-PAGE, il che costituisce di per sé un utile controllo di identità.

Origine e struttura

Il disegno deriva direttamente dalla genetica della via della miostatina. La miostatina (GDF-8) è un regolatore negativo della massa muscolare scheletrica; animali ed esseri umani portatori di varianti con perdita di funzione mostrano una marcata ipertrofia muscolare. Poiché la miostatina segnala attraverso ActRIIB, la presenza di un eccesso di ActRIIB solubile nello spazio extracellulare sottrae il ligando al recettore di membrana per competizione.

Il dettaglio ingegneristico più importante è che cos'altro lega ActRIIB. Il suo repertorio naturale di ligandi comprende activina A e activina B, GDF-11 (uno stretto omologo della miostatina con ruoli nello sviluppo) e diverse proteine morfogenetiche dell'osso, tra cui BMP9 e BMP10. Una trappola solubile di ActRIIB rimuove quindi dalla circolazione più della sola miostatina, e i successivi lavori di ingegneria in questa classe si sono concentrati proprio sul restringimento di tale promiscuità.

Come si ritiene che agisca ACE-031

Il meccanismo è il sequestro competitivo del ligando a monte del recettore. Con il ligando legato alla trappola, ActRIIB sulla superficie del miocita non viene attivato, il recettore di tipo I (ALK4/ALK5) non viene reclutato né fosforilato e la segnalazione SMAD2/3 verso il nucleo diminuisce. Nei modelli muscolari ciò allevierebbe, secondo quanto riportato, la soppressione trascrizionale dei programmi di crescita e sposterebbe l'equilibrio verso la segnalazione della sintesi proteica associata ad Akt/mTOR.

Dall'ampio profilo di legame derivano due conseguenze meccanicistiche. In primo luogo, negli studi preclinici sono stati riportati effetti sull'osso accanto a quelli sul muscolo, in linea con il coinvolgimento di activine e BMP nel rimodellamento osseo. In secondo luogo, e con conseguenze maggiori, la segnalazione di BMP9 e BMP10 attraverso ALK1 nell'endotelio vascolare è un riconosciuto regolatore dell'integrità vascolare, e i riscontri vascolari che hanno posto fine allo sviluppo clinico di ACE-031 sono generalmente attribuiti in letteratura a quel braccio anziché alla via muscolare. Per un ricercatore, ciò rende ACE-031 una trappola ad ampio spettro per i ligandi di ActRIIB anziché uno strumento specifico per la miostatina, e la distinzione va dichiarata esplicitamente in qualsiasi interpretazione.

Rispetto a Follistatin-344, che lega direttamente i ligandi, e al propeptide GDF-8 / miostatina, che è l'inibitore naturale del ligando stesso ed è il più selettivo dei tre, ACE-031 blocca l'asse all'interfaccia con il recettore. La scelta tra di essi è una vera decisione sperimentale su dove collocare l'intervento lungo la via.

Cosa ha esaminato la ricerca

Modelli preclinici di muscolo e osso

Studi sui roditori con costrutti solubili ActRIIB-Fc hanno riportato aumenti sostanziali della massa magra e delle dimensioni delle fibre muscolari, anche in modelli distrofici e di cachessia, e studi separati hanno riportato aumenti della densità minerale ossea. Sono questi i risultati che hanno motivato lo sviluppo clinico.

Farmacologia umana di fase 1

Uno studio di fase 1 su volontarie sane in postmenopausa ha riportato aumenti della massa magra e variazioni dei marcatori di formazione ossea e di massa grassa dopo una singola somministrazione, insieme a dati farmacocinetici coerenti con l'emivita prolungata dal frammento Fc. È l'evidenza umana pubblicata più chiara che il meccanismo coinvolge il proprio bersaglio nell'uomo.

Studi sulla distrofia muscolare di Duchenne e interruzione

Un programma di fase 2 in ragazzi con distrofia muscolare di Duchenne è stato sospeso nel 2013. Il motivo riportato non era la mancanza di effetto sul muscolo, bensì riscontri extramuscolari (epistassi, sanguinamento gengivale e vasi sanguigni superficiali dilatati) coerenti con un'interferenza nella segnalazione vascolare BMP9/BMP10–ALK1. Lo sviluppo di ACE-031 non è stato ripreso. Qualsiasi uso di ricerca di questa molecola andrebbe inquadrato tenendo presente questo esito.

Molecole successive

La classe non si è esaurita lì. Successivamente sono stati sviluppati agenti diretti su ActRII più selettivi, tra cui trappole per ligandi ingegnerizzate con profili di legame ristretti e anticorpi monoclonali contro il recettore, e diversi hanno ottenuto l'approvazione in indicazioni ematologiche e polmonari. ACE-031 si comprende meglio come il composto di prima generazione i cui limiti hanno definito i disegni successivi.

Forme e formati forniti

Il flaconcino da 1 mg rappresenta una grande quantità molare per una proteina usata a concentrazioni di lavoro nanomolari, quindi aliquotare l'intero flaconcino alla prima ricostituzione è prassi normale. Le considerazioni sull'approvvigionamento sono trattate nella nostra guida all'acquisto di ACE-031.

Ricostituzione e conservazione in laboratorio

Le proteine di fusione Fc sono la categoria di materiale più fragile in un catalogo di peptidi e vanno manipolate di conseguenza. Si aggiunge lentamente acqua sterile o batteriostatica lungo la parete del flaconcino e lo si lascia riposare; agitare o passare al vortex una grande glicoproteina produce un'aggregazione indotta da sforzo di taglio che nessun ulteriore mescolamento può invertire. Un'opalescenza persistente dopo la dissoluzione indica formazione di aggregati e va interpretata come un problema di qualità, non di miscelazione.

Il calcolo della concentrazione è semplice (1 mg portato a 1 mL corrisponde a 1 mg/mL, e 0.1 mL contengono 100 mcg), ma le concentrazioni di lavoro sperimentali sono molto inferiori, e a quei livelli l'adsorbimento su plastica e vetro diventa la causa principale di perdita. Una proteina carrier come l'albumina sierica bovina allo 0.1% nelle soluzioni madre diluite è prassi standard, e sono preferibili provette a basso legame. Il metodo generale è descritto nella nostra guida alla ricostituzione.

I flaconcini liofilizzati si conservano a −20 °C, sigillati e protetti da luce e umidità. Il materiale ricostituito si usa a 2–8 °C per il lavoro immediato oppure si aliquota e si congela; congelamenti e scongelamenti ripetuti di una proteina di fusione Fc generano sistematicamente aggregati e perdita di attività. Indicazioni più ampie sono disponibili in come conservare i peptidi.

Purezza, COA e come leggerlo

Il certificato di una proteina di fusione riporta informazioni diverse da quello di un peptide, e le sezioni informative sono quelle non HPLC. L'SDS-PAGE in condizioni riducenti e non riducenti deve mostrare il monomero e il dimero legato da ponti disolfuro alle dimensioni attese; una corsia non riducente che mostri prevalentemente monomero indica un costrutto non assemblato correttamente. La cromatografia a esclusione dimensionale, se fornita, quantifica gli aggregati ad alto peso molecolare, che sono il difetto che più spesso spiega un flaconcino inattivo. Devono essere indicati il sistema di espressione e lo stato di glicosilazione, e il contenuto di endotossine è rilevante per qualsiasi saggio cellulare. Un valore di bioattività ottenuto da un saggio di legame o con gene reporter è più significativo di qualsiasi percentuale di purezza. La nostra guida alla lettura del certificato di analisi illustra come queste sezioni si collegano.

Status regolatorio

ACE-031 non ha un'autorizzazione all'immissione in commercio in alcun paese. Lo sviluppo clinico è stato interrotto nel 2013 e non è stato ripreso, quindi non esiste un prodotto di riferimento né un'etichettatura approvata per questa molecola. Gli agenti della via della miostatina sono vietati nello sport dalle norme antidoping.

Gli altri due modi per bloccare questo asse presenti nel nostro catalogo sono Follistatin-344, un'ampia trappola per ligandi, e il propeptide GDF-8 / miostatina, il più selettivo per il ligando del gruppo. Un contesto più ampio su come si collocano le famiglie di ricerca legate al muscolo si trova nella nostra panoramica sui peptidi per la ricerca sulla crescita muscolare.

Domande

Che tipo di molecola è ACE-031?

Una proteina di fusione, non un peptide. Unisce il dominio extracellulare di legame del ligando del recettore dell'activina umano di tipo IIB alla regione Fc dell'IgG1 umana, formando un omodimero legato da ponti disolfuro con due bracci di legame. Il modulo Fc induce la dimerizzazione e prolunga la persistenza in circolo attraverso il riciclo mediato dal recettore Fc neonatale.

In che modo ACE-031 blocca la segnalazione della miostatina?

Mediante sequestro competitivo a monte del recettore. L'ActRIIB solubile nello spazio extracellulare cattura il ligando, così che l'ActRIIB di membrana non viene attivato, il recettore di tipo I non viene reclutato e la segnalazione SMAD2/3 verso il nucleo diminuisce.

ACE-031 è selettivo per la miostatina?

No. ActRIIB lega activina A e B, GDF-11 e diverse proteine morfogenetiche dell'osso, tra cui BMP9 e BMP10, quindi una trappola solubile di ActRIIB rimuove più della sola miostatina. Questa promiscuità è il limite interpretativo che definisce la molecola e ha guidato il disegno degli agenti successivi, più selettivi.

Perché lo sviluppo di ACE-031 è stato interrotto?

Un programma di fase 2 sulla distrofia muscolare di Duchenne è stato sospeso nel 2013 a seguito di riscontri extramuscolari (epistassi, sanguinamento gengivale e vasi sanguigni superficiali dilatati) coerenti con un'interferenza nella segnalazione vascolare BMP9/BMP10–ALK1. Lo sviluppo non è stato ripreso.

Come si confronta ACE-031 con Follistatin-344?

Bloccano lo stesso asse in punti diversi. La follistatina lega direttamente i ligandi e ha nell'activina A il partner a più alta affinità; ACE-031 presenta una versione esca del recettore che quei ligandi attiverebbero altrimenti. Profili di legame, dimensioni e requisiti di manipolazione sono tutti diversi.

Cosa dovrebbe mostrare un certificato di analisi di ACE-031?

SDS-PAGE in condizioni riducenti e non riducenti che confermi sia il monomero sia il dimero legato da ponti disolfuro, dati di esclusione dimensionale che quantifichino gli aggregati ad alto peso molecolare, sistema di espressione e stato di glicosilazione, contenuto di endotossine e, idealmente, un valore di bioattività da saggio di legame o con gene reporter. La sola percentuale di purezza dice poco su una proteina di fusione.

Come va ricostituito ACE-031?

Lentamente e senza agitazione: acqua sterile o batteriostatica lungo la parete del flaconcino, lasciando poi riposare. Agitare o passare al vortex una grande glicoproteina causa un'aggregazione indotta da sforzo di taglio irreversibile. Un'opalescenza persistente dopo la dissoluzione indica formazione di aggregati, non un mescolamento incompleto.