Soortreactiviteit

Soortreactiviteit is het veld in de datasheet dat aangeeft welke soortvorm van een doelwit een antilichaam of assaykit herkent — mens, muis, rat enzovoort. Het volgt rechtstreeks uit de sequentie van het immunogeen: een antilichaam herkent een epitoop, en als dat stuk sequentie tussen soorten geconserveerd is, zal het reagens doorgaans kruisreageren.

Getest versus voorspeld

Dat onderscheid is precies waarom u het veld zorgvuldig moet lezen. "Geteste" reactiviteit betekent dat de leverancier het reagens in een vermelde toepassing op een monster van die soort heeft getest. "Voorspelde" reactiviteit is een afleiding uit sequentiehomologie — vaak vermeld met een identiteitspercentage — en is een hypothese, geen data. Homologie faalt bovendien asymmetrisch: één substitutie in een kort lineair epitoop kan de binding opheffen, zelfs bij 95% totale identiteit, terwijl een volledig geconserveerd epitoop reactiviteit kan geven in een soort die de leverancier nooit heeft getest.

Nog twee valkuilen. Reactiviteit kan per toepassing verschillen: een antilichaam kan bij de rat werken voor westernblot maar niet voor immunohistochemie, omdat gedenatureerde en natieve epitopen verschillen. En de gastheersoort doet ertoe — een monoklonaal muizenantilichaam op muizenweefsel geeft veel achtergrond, tenzij een mouse-on-mouse-blokkeersysteem wordt gebruikt. Dezelfde conserveringslogica geldt voor peptiden zelf, waarbij natieve sequenties van knaagdier en mens vaak verschillen.

Gerelateerde termen en materiaal

polyklonaal versus monoklonaal · ELISA · in vivo. Referentiemateriaal: antilichamen, assaykits.