Glossário
Sequência nativa
Corresponde ao péptido tal como ocorre numa dada espécie, sem substituições. Porque a espécie importa e porque nativo não é sinónimo de durável.
Sequência nativa designa um péptido cuja ordem de aminoácidos corresponde à molécula tal como ocorre naturalmente num organismo especificado, sem substituições, bloqueios terminais, truncagens ou conjugados. A indicação da espécie é essencial: as versões humana, de rato e suína da mesma hormona diferem frequentemente em um ou mais resíduos, e um péptido pode ser nativo para uma espécie e um análogo relativamente a outra.
Porque a sequência nativa é importante na investigação de péptidos
O material nativo é a referência adequada quando a questão diz respeito à biologia endógena — caracterização de recetores, produção de anticorpos, padrões de ensaio ou estabelecimento de uma linha de base face à qual uma molécula modificada é comparada. Exemplos do catálogo incluem a oxitocina, o LL-37 e a glutationa, todos fornecidos com a sequência de ocorrência natural.
Nativo não implica robusto. Os péptidos sinalizadores endógenos estão tipicamente concebidos para uma depuração rápida, pelo que as suas formas não modificadas têm semividas muito curtas — o GLP-1 nativo dura cerca de dois minutos, contra cerca de uma semana para o seu análogo obtido por engenharia. Nativo também não implica fidelidade pós-traducional: uma sequência nativa sintética não tem qualquer glicosilação ou fosforilação presente in vivo, a menos que tenha sido deliberadamente introduzida. Compare a produção recombinante e sintética; veja como ler uma sequência.
Termos relacionados
fragmento · péptido linear