Sequenza nativa

Sequenza nativa indica un peptide il cui ordine di amminoacidi corrisponde a quello della molecola presente in natura in un determinato organismo, senza sostituzioni, blocchi terminali, troncamenti o coniugati. L'indicazione della specie è essenziale: le versioni umana, di ratto e suina dello stesso ormone differiscono spesso per uno o più residui, e un peptide può essere nativo per una specie e un analogo rispetto a un'altra.

Perché la sequenza nativa è importante nella ricerca sui peptidi

Il materiale nativo è il riferimento appropriato quando la domanda riguarda la biologia endogena: caratterizzazione dei recettori, produzione di anticorpi, standard di dosaggio o definizione di una linea di base rispetto alla quale confrontare una molecola modificata. Esempi a catalogo sono ossitocina, LL-37 e glutatione, tutti forniti come sequenza presente in natura.

Nativo non significa robusto. I peptidi di segnalazione endogeni sono tipicamente fatti per essere eliminati rapidamente, per cui le loro forme non modificate hanno emivite molto brevi: il GLP-1 nativo dura circa due minuti, contro circa una settimana per il suo analogo ingegnerizzato. Né nativo implica fedeltà post-traduzionale: una sequenza nativa sintetica è priva di qualsiasi glicosilazione o fosforilazione presente in vivo, a meno che non sia stata introdotta deliberatamente. Si confrontino la produzione ricombinante e quella sintetica; si veda come leggere una sequenza.

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