Glossar
Native Sequenz
Eine native Sequenz entspricht dem Peptid, wie es in einer Spezies vorkommt, ohne Substitutionen. Warum die Spezies zählt und nativ nicht haltbar bedeutet.
Native Sequenz bezeichnet ein Peptid, dessen Aminosäureabfolge dem Molekül entspricht, wie es in einem bestimmten Organismus natürlich vorkommt — ohne Substitutionen, terminale Verkappungen, Verkürzungen oder Konjugate. Die Angabe der Spezies ist unerlässlich: Humane, Ratten- und Schweineversionen desselben Hormons unterscheiden sich häufig in einem oder mehreren Resten, und ein Peptid kann für die eine Spezies nativ und relativ zu einer anderen ein Analogon sein.
Warum die native Sequenz in der Peptidforschung wichtig ist
Natives Material ist die geeignete Referenz, wenn es um endogene Biologie geht — Rezeptorcharakterisierung, Antikörpergenerierung, Assay-Standards oder die Festlegung einer Ausgangsbasis, mit der ein modifiziertes Molekül verglichen wird. Beispiele aus dem Katalog sind Oxytocin, LL-37 und Glutathion, die alle als natürlich vorkommende Sequenz geliefert werden.
Nativ bedeutet nicht robust. Endogene Signalpeptide sind typischerweise auf schnelle Clearance ausgelegt, sodass ihre unmodifizierten Formen sehr kurze Halbwertszeiten haben — natives GLP-1 überdauert etwa zwei Minuten, sein konstruiertes Analogon rund eine Woche. Nativ bedeutet auch keine posttranslationale Treue: Einer synthetischen nativen Sequenz fehlt jede Glykosylierung oder Phosphorylierung, die in vivo vorhanden ist, sofern sie nicht gezielt eingeführt wurde. Vergleichen Sie rekombinante und synthetische Herstellung; siehe Sequenzen lesen.
Verwandte Begriffe
Fragment · lineares Peptid