Woordenlijst
AMPK
AMPK is een heterotrimeer kinase dat wordt geactiveerd wanneer de AMP:ATP-verhouding stijgt. De subeenheden, upstream kinasen en metabole doelwitten.
AMPK (AMP-geactiveerd proteïnekinase) is een heterotrimeer enzym dat is opgebouwd uit een katalytische alfasubeenheid en regulerende bèta- en gammasubeenheden. Adeninenucleotiden binden aan de gammasubeenheid: naarmate ATP wordt verbruikt en de AMP:ATP- en ADP:ATP-verhoudingen stijgen, bevordert AMP-binding de fosforylering van Thr172 op de alfasubeenheid door LKB1 en beschermt ze die plaats tegen defosforylering. Activatie via calcium door CaMKK2 vormt een tweede, energieonafhankelijke route.
Waarom AMPK ertoe doet
Eenmaal actief fosforyleert AMPK doelwitten die ATP-verbruikende synthese stilleggen en ATP-producerend katabolisme openzetten: ACC1 en ACC2 (vetzuursynthese en -oxidatie), HMG-CoA-reductase, TBC1D1, en ULK1 en TSC2, wat het verbindt met autofagie en met onderdrukking van mTORC1. Het is daarom de uitlezing waartegen de meeste metabole onderzoeksverbindingen worden gescreend, en het staat in het standaardschema van nutriëntdetectie tegenover mTOR, naast sirtuïnen en NAD+.
Toeschrijving is hier belangrijk: AICAR activeert AMPK rechtstreeks via de metaboliet ZMP, terwijl metformine, een referentieverbinding die alleen op recept verkrijgbaar is, volgens de literatuur doorgaans indirect werkt via remming van complex I en de daaruit volgende verschuiving in nucleotiden. Geen van beide mechanismen mag als uitkomstclaim worden gelezen.
Gerelateerde termen en materiaal
PPAR-delta · mitochondriaal afgeleid peptide · in vitro. Referentiemateriaal: MOTS-c, mitochondriale peptiden. Verder lezen: wat is AICAR.