Słownik
AMPK
AMPK to heterotrimeryczna kinaza aktywowana, gdy rośnie stosunek AMP:ATP. Jej podjednostki, kinazy nadrzędne i docelowe szlaki metaboliczne.
AMPK (kinaza białkowa aktywowana przez AMP) to heterotrimeryczny enzym zbudowany z katalitycznej podjednostki alfa oraz regulatorowych podjednostek beta i gamma. Nukleotydy adeninowe wiążą się z podjednostką gamma: gdy ATP jest zużywane, a stosunki AMP:ATP i ADP:ATP rosną, związanie AMP sprzyja fosforylacji Thr172 podjednostki alfa przez LKB1 i chroni to miejsce przed defosforylacją. Drugą, niezależną od stanu energetycznego drogę stanowi aktywacja zależna od wapnia poprzez CaMKK2.
Dlaczego AMPK ma znaczenie
Aktywna AMPK fosforyluje cele, które wyłączają zużywające ATP procesy syntezy i uruchamiają katabolizm generujący ATP: ACC1 i ACC2 (synteza i utlenianie kwasów tłuszczowych), reduktazę HMG-CoA, TBC1D1 oraz ULK1 i TSC2, co wiąże ją z autofagią i hamowaniem mTORC1. Jest więc wskaźnikiem, względem którego testuje się większość metabolicznych związków badawczych, a na standardowym schemacie wykrywania składników odżywczych znajduje się naprzeciw mTOR, obok sirtuin i NAD+.
Istotne jest tu właściwe przypisanie mechanizmu: AICAR aktywuje AMPK bezpośrednio poprzez swój metabolit ZMP, natomiast metformina, związek referencyjny dostępny wyłącznie na receptę, działa według ogólnie przyjętych doniesień pośrednio, przez hamowanie kompleksu I i wynikające z tego przesunięcie puli nukleotydów. Żadnego z tych mechanizmów nie należy odczytywać jako deklaracji efektu.
Powiązane terminy i materiały
PPAR-delta · peptyd pochodzenia mitochondrialnego · in vitro. Materiały referencyjne: MOTS-c, peptydy mitochondrialne. Dalsza lektura: czym jest AICAR.