Ligação peptídica

Uma ligação peptídica é a ligação amida formada quando o grupo carboxilo de um aminoácido se condensa com o grupo amino do seguinte, libertando uma molécula de água. É o esqueleto covalente de qualquer péptido, e as suas propriedades físicas explicam muito daquilo em torno do qual os químicos de péptidos concebem as suas moléculas.

Estrutura e consequências

A ressonância confere à ligação C–N um carácter parcial de ligação dupla, pelo que a unidade amida é planar e a rotação em torno dela é restrita; a liberdade conformacional reside, em vez disso, nos ângulos phi e psi adjacentes. Essa planaridade explica porque os esqueletos se dobram em hélices e voltas previsíveis. A ligação é termodinamicamente instável face à hidrólise, mas cineticamente muito lenta — as semividas não catalisadas a pH neutro medem-se em séculos —, pelo que, em meios biológicos, são as proteases, e não a água, a via prática de degradação.

Porque é importante

Todas as estratégias para prolongar a semivida de um péptido visam este esqueleto ou os seus vizinhos: substituição por D-aminoácidos, inserção de Aib, acetilação N-terminal, amidação C-terminal ou acilação com ácidos gordos que promove a ligação à albumina. No fabrico, formar uma ligação é o passo repetido da síntese de péptidos em fase sólida; um acoplamento incompleto em qualquer posição deixa sequências de deleção que surgem como ombros na HPLC e como lacunas de massa na MS.

Termos relacionados

aminoácido · degradação · ponte dissulfureto. Leitura complementar: estabilidade e semivida dos péptidos.