Legame peptidico

Un legame peptidico è il legame ammidico che si forma quando il gruppo carbossilico di un amminoacido condensa con il gruppo amminico del successivo, liberando una molecola d'acqua. È lo scheletro covalente di ogni peptide, e le sue proprietà fisiche spiegano gran parte dei vincoli attorno ai quali progettano i chimici dei peptidi.

Struttura e conseguenze

La risonanza conferisce al legame C–N un parziale carattere di doppio legame, per cui l'unità ammidica è planare e la rotazione attorno a essa è limitata; la libertà conformazionale risiede invece negli angoli phi e psi adiacenti. Questa planarità spiega perché gli scheletri si ripiegano in eliche e ripiegamenti prevedibili. Il legame è termodinamicamente instabile rispetto all'idrolisi ma cineticamente molto lento (le emivite non catalizzate a pH neutro si misurano in secoli), per cui nei mezzi biologici la via pratica di degradazione sono le proteasi, non l'acqua.

Perché è importante

Ogni strategia per prolungare l'emivita di un peptide agisce su questo scheletro o sulle posizioni vicine: sostituzione con D-amminoacidi, inserimento di Aib, acetilazione N-terminale, amidazione C-terminale o acilazione con acidi grassi che favorisce il legame all'albumina. In produzione, la formazione di un legame è il passaggio ripetuto della sintesi peptidica in fase solida; un accoppiamento incompleto in qualsiasi posizione lascia sequenze con delezioni che compaiono come picchi a spalla in HPLC e come scarti di massa in MS.

Termini correlati

amminoacido · degradazione · ponte disolfuro. Approfondimenti: stabilità ed emivita dei peptidi.