Peptidă ciclică

O peptidă ciclică este o peptidă al cărei schelet sau ale cărei catene laterale sunt unite printr-o legătură covalentă, formând un inel. Sunt recunoscute patru tipuri de închidere: cap-coadă, care unește capetele N- și C-terminale; catenă laterală-catenă laterală, cel mai frecvent o punte disulfurică sau o lactamă între lizină și glutamat; cap-catenă laterală; și catenă laterală-coadă.

De ce contează ciclizarea în cercetarea peptidelor

Rezultă trei efecte. Rezistența la proteaze se îmbunătățește, deoarece exopeptidazele au nevoie de un capăt liber pentru a ataca, iar un inel cap-coadă nu oferă niciunul. Entropia conformațională scade, astfel încât molecula petrece mai mult timp într-o conformație compatibilă cu legarea, ceea ce crește de regulă atât afinitatea, cât și selectivitatea. În plus, unele peptide ciclice ating o permeabilitate membranară neobișnuită prin ecranarea legăturilor de hidrogen ale scheletului în interiorul inelului — proprietatea care face ca ciclosporina să fie absorbită oral în ciuda dimensiunii sale.

Exemplele relevante din catalog includ inelele închise prin punți disulfurice ale oxitocinei și somatostatinei, precum și Melanotan II, constrâns conformațional, comparat cu rudele sale mai flexibile. Ciclizarea este o strategie de design din aceeași familie cu PEGilarea și DAC — toate prelungesc durata de viață utilă, însă ciclizarea face acest lucru prin rezistența la scindare, nu prin încetinirea eliminării. Comparați cu peptidele liniare; consultați modul în care se scriu secvențele.

Termeni înrudiți

timp de înjumătățire · analog