Peptide ciclico

Un peptide ciclico è un peptide in cui lo scheletro o le catene laterali sono uniti da un legame covalente a formare un anello. Si distinguono quattro tipi di chiusura: testa-coda, che unisce N- e C-terminale; catena laterale-catena laterale, più comunemente un ponte disolfuro o un lattame tra lisina e glutammato; testa-catena laterale; e catena laterale-coda.

Perché la ciclizzazione è importante nella ricerca sui peptidi

Ne derivano tre effetti. La resistenza alle proteasi migliora, perché le esopeptidasi hanno bisogno di un'estremità libera da attaccare e un anello testa-coda non ne offre alcuna. L'entropia conformazionale diminuisce, per cui la molecola trascorre più tempo in una conformazione idonea al legame, il che in genere aumenta sia l'affinità sia la selettività. Inoltre alcuni peptidi ciclici raggiungono una permeabilità di membrana insolita schermando i legami idrogeno dello scheletro all'interno dell'anello: la proprietà che rende la ciclosporina assorbibile per via orale nonostante le sue dimensioni.

Esempi rilevanti per il catalogo includono gli anelli chiusi da disolfuro di ossitocina e somatostatina e il vincolato Melanotan II, confrontato con i suoi parenti più flessibili. La ciclizzazione è una strategia di design della stessa famiglia di PEGilazione e DAC: tutte prolungano la vita utile, ma la ciclizzazione lo fa resistendo alla scissione anziché rallentando la clearance. Si confrontino i peptidi lineari; si veda come si scrivono le sequenze.

Termini correlati

emivita · analogo