Peptide cyclique

Un peptide cyclique est un peptide dont le squelette ou les chaînes latérales sont reliés par une liaison covalente formant un cycle. Quatre types de fermeture sont reconnus : tête-à-queue, reliant les extrémités N- et C-terminales ; chaîne latérale à chaîne latérale, le plus souvent un pont disulfure ou un lactame entre lysine et glutamate ; tête-à-chaîne latérale ; et chaîne latérale-à-queue.

Pourquoi la cyclisation compte en recherche sur les peptides

Trois effets en découlent. La résistance aux protéases s’améliore, car les exopeptidases ont besoin d’une extrémité libre pour attaquer et un cycle tête-à-queue n’en offre aucune. L’entropie conformationnelle diminue, de sorte que la molécule passe plus de temps dans une forme apte à la liaison, ce qui augmente généralement l’affinité comme la sélectivité. Enfin, certains peptides cycliques atteignent une perméabilité membranaire inhabituelle en masquant les liaisons hydrogène du squelette à l’intérieur du cycle — la propriété qui rend la ciclosporine absorbable par voie orale malgré sa taille.

Parmi les exemples pertinents pour le catalogue figurent les cycles fermés par pont disulfure de l’ocytocine et de la somatostatine, ainsi que le Melanotan II contraint, comparé à ses parents plus flexibles. La cyclisation est une stratégie de conception de la même famille que la PEGylation et le DAC — toutes prolongent la durée de vie utile, mais la cyclisation y parvient en résistant au clivage plutôt qu’en ralentissant la clairance. Comparez avec les peptides linéaires ; voyez comment s’écrivent les séquences.

Termes associés

demi-vie · analogue