Cyclisch peptide

Een cyclisch peptide is een peptide waarvan de ruggengraat of zijketens door een covalente binding tot een ring zijn verbonden. Er worden vier sluitingstypen onderscheiden: kop-staart, waarbij N- en C-terminus worden verbonden; zijketen-zijketen, meestal een disulfidebrug of een lactam tussen lysine en glutamaat; kop-zijketen; en zijketen-staart.

Waarom cyclisering ertoe doet in peptideonderzoek

Er volgen drie effecten. De resistentie tegen proteasen neemt toe, omdat exopeptidasen een vrije terminus nodig hebben om aan te grijpen en een kop-staartring er geen biedt. De conformationele entropie daalt, zodat het molecuul meer tijd doorbrengt in een bindingsbekwame vorm, wat doorgaans zowel de affiniteit als de selectiviteit verhoogt. En sommige cyclische peptiden bereiken een ongewone membraanpermeabiliteit door waterstofbruggen van de ruggengraat binnen de ring af te schermen — de eigenschap die ervoor zorgt dat ciclosporine ondanks zijn omvang oraal wordt geabsorbeerd.

Voorbeelden die voor de catalogus relevant zijn, zijn de met disulfide gesloten ringen van oxytocine en somatostatine, en het beperkte Melanotan II in vergelijking met zijn flexibelere verwanten. Cyclisering is een ontwerpstrategie uit dezelfde familie als PEGylering en DAC — alle verlengen de bruikbare levensduur, maar cyclisering doet dat door splitsing te weerstaan in plaats van de klaring te vertragen. Vergelijk lineaire peptiden; zie hoe sequenties worden genoteerd.

Gerelateerde termen

halfwaardetijd · analoog