Glosar
Sare TFA
Majoritatea peptidelor sintetice sunt livrate ca săruri de trifluoroacetat. Cât din masa flaconului este contraion și când TFA interferează cu testele celulare.
Sarea TFA înseamnă că peptida este furnizată cu trifluoroacetatul drept contraion, asociat cu resturile bazice încărcate pozitiv din secvență. Este forma implicită deoarece acidul trifluoroacetic este folosit atât pentru clivarea peptidei de pe rășină la finalul SPPS, cât și ca agent de împerechere ionică în HPLC preparativă în fază inversă, astfel încât este prezent în fiecare etapă ulterioară, dacă nu este înlocuit deliberat.
De ce contează forma de sare TFA în cercetarea peptidelor
Două consecințe. Prima este bilanțul de masă: conținutul de TFA variază frecvent între aproximativ 10% și 25% din masa brută, în funcție de numărul de resturi bazice din secvență, astfel încât un flacon etichetat cu 5 mg poate conține semnificativ mai puțin de 5 mg de peptidă. Orice calcul de molaritate ar trebui, prin urmare, să pornească de la conținutul net de peptidă din certificatul de analiză, nu de la etichetă.
A doua este interferența cu testele. TFA rezidual este raportat ca fiind citotoxic pentru unele linii celulare și ca afectând parametrii de proliferare celulară la concentrații mult sub cele care afectează peptida, astfel încât lucrările pe culturi celulare necesită adesea sarea de acetat. TFA produce, de asemenea, o bandă caracteristică în infraroșu care poate perturba lucrările spectroscopice. Consultați interpretarea unui COA.
Termeni înrudiți
puritate · excipient · sintetic