Glossario
Sale TFA
La maggior parte dei peptidi sintetici è un sale trifluoroacetato. Quanta massa del flaconcino è controione e quando il TFA interferisce nei saggi cellulari.
Sale TFA significa che il peptide è fornito con il trifluoroacetato come controione, associato ai residui basici con carica positiva presenti nella sequenza. È la forma predefinita perché l'acido trifluoroacetico viene impiegato sia per scindere il peptide dalla resina al termine della SPPS sia come agente di accoppiamento ionico nell'HPLC preparativa in fase inversa, per cui è presente in ogni fase successiva, a meno che non venga deliberatamente scambiato.
Perché la forma salina TFA è importante nella ricerca sui peptidi
Le conseguenze sono due. La prima riguarda il bilancio di massa: il contenuto di TFA varia comunemente da circa il 10% al 25% del peso lordo, a seconda del numero di residui basici presenti nella sequenza, per cui un flaconcino etichettato da 5 mg può contenere sensibilmente meno di 5 mg di peptide. Qualsiasi calcolo di molarità dovrebbe quindi partire dal contenuto peptidico netto riportato sul certificato di analisi, non dall'etichetta.
La seconda è l'interferenza nei saggi. Il TFA residuo risulta citotossico per alcune linee cellulari e in grado di influenzare le misure di proliferazione cellulare a concentrazioni ben inferiori a quelle che danneggiano il peptide, per cui il lavoro su cellule richiede spesso il sale acetato. Il TFA produce inoltre una banda infrarossa caratteristica che può confondere le analisi spettroscopiche. Si veda come leggere un COA.
Termini correlati
purezza · eccipiente · sintetico