Glossaire
Sel de TFA
La plupart des peptides synthétiques sont livrés en sels de trifluoroacétate. Part du contre-ion dans la masse du flacon, et interférences du TFA en culture.
Un sel de TFA signifie que le peptide est fourni avec le trifluoroacétate comme contre-ion, apparié aux résidus basiques chargés positivement de la séquence. C’est la forme par défaut, car l’acide trifluoroacétique sert à la fois à cliver le peptide de la résine à la fin de la SPPS et d’agent d’appariement d’ions en HPLC préparative en phase inverse ; il est donc présent à chaque étape en aval, sauf échange délibéré.
Pourquoi la forme sel de TFA est importante dans la recherche sur les peptides
Deux conséquences. D’abord, le bilan massique : la teneur en TFA représente couramment de 10 % à 25 % environ de la masse brute, selon le nombre de résidus basiques de la séquence, de sorte qu’un flacon étiqueté 5 mg peut contenir sensiblement moins de 5 mg de peptide. Tout calcul de molarité doit donc partir de la teneur nette en peptide indiquée sur le certificat d’analyse, et non de l’étiquette.
Ensuite, l’interférence avec les dosages. Le TFA résiduel serait cytotoxique pour certaines lignées cellulaires et influerait sur les mesures de prolifération cellulaire à des concentrations bien inférieures à celles qui altèrent le peptide ; les travaux sur cellules requièrent donc souvent le sel d’acétate. Le TFA produit en outre une bande infrarouge caractéristique susceptible de perturber les travaux spectroscopiques. Voir lire un COA.
Termes associés
pureté · excipient · synthétique