Glosář
Hydrofilní
Hydrofilní znamená „milující vodu“. Proč se většina výzkumných peptidů snadno rozpouští v bakteriostatické vodě a proč tatáž vlastnost brání průchodu membránou.
Hydrofilní označuje molekulu nebo zbytek, který příznivě interaguje s vodou prostřednictvím vodíkových vazeb nebo náboje. U peptidů tento charakter pochází z nabitých postranních řetězců (aspartát, glutamát, lysin, arginin, histidin), polárních řetězců (serin, threonin, asparagin, glutamin) a ze samotných amidových skupin páteře, které jsou donory i akceptory vodíkových vazeb po celé délce řetězce.
Proč je hydrofilnost ve výzkumu peptidů důležitá
Vysvětluje dvě určující praktické skutečnosti o výzkumných peptidech. Jejich rozpuštění je obvykle snadné: lyofilizát hydrofilní sekvence přejde do bakteriostatické vody při jemném kroužení bez korozpouštědla, a proto standardní rekonstituce funguje u většiny katalogu. Jejich průchod membránami je téměř nemožný: tatáž schopnost tvořit vodíkové vazby, která z vody činí dobré rozpouštědlo, činí z lipidové dvojvrstvy rozpouštědlo špatné, což je strukturní důvod, proč perorální biologická dostupnost leží blízko nuly a proč převládají parenterální nebo slizniční cesty.
Hydrofilnost také určuje chromatografické chování: v HPLC s reverzní fází eluují hydrofilní peptidy brzy při nízkém obsahu organické složky, takže retenční čas v certifikátu analýzy je sám o sobě jen slabým důkazem o charakteru sekvence. Je-li sekvence neobvykle hydrofilní, je adsorpce na plast minimální, což pomáhá při přípravě alikvotu.
Související pojmy
lipofilní · izoelektrický bod