Degradazione

Degradazione è il termine collettivo per qualsiasi processo attraverso il quale un peptide cessa di essere la molecola prevista. Conviene distinguere le vie chimiche, che alterano la struttura covalente, da quelle fisiche, che alterano lo stato senza modificarne la chimica.

Le principali vie di degradazione

L'idrolisi scinde il legame peptidico stesso, accelerata da acqua, calore e valori estremi di pH, e le sequenze Asp-Pro sono particolarmente labili. La deamidazione converte asparagina o glutammina nelle rispettive forme acide tramite un intermedio succinimmidico, aggiungendo 1 Da e generando spesso un isoaspartato che altera la conformazione; i motivi Asn-Gly sono il classico punto critico. L'ossidazione aggiunge 16 Da per ogni ossigeno su metionina, cisteina o triptofano. Il rimescolamento dei disolfuri riassortisce gli appaiamenti delle cisteine nelle sequenze ciclizzate. Sul piano fisico, l'aggregazione porta le catene solubili a formare oligomeri e particolato visibile, e l'adsorbimento sottrae semplicemente peptide depositandolo sulle pareti del contenitore.

Perché è importante

Ogni via ha una firma. L'HPLC mostra nuovi picchi o uno spostamento del picco principale, mentre la spettrometria di massa mostra il caratteristico spostamento di massa: più 16 per l'ossidazione, più 1 per la deamidazione, una massa inferiore per la scissione. Un lotto degradato può comunque apparire perfetto, ed è per questo che le condizioni di conservazione e un certificato di analisi aggiornato contano più dell'aspetto. Si veda la guida alla conservazione.

Termini correlati

stabilità · congelamento–scongelamento