Glossar
Abbau
Abbau umfasst jeden Weg, auf dem ein Peptid aufhört, es selbst zu sein: Hydrolyse, Deamidierung, Oxidation, Aggregation. Woran man sie erkennt.
Abbau (Degradation) ist der Sammelbegriff für jeden Prozess, durch den ein Peptid nicht mehr das beabsichtigte Molekül ist. Es lohnt sich, zwischen chemischen Wegen, die die kovalente Struktur verändern, und physikalischen Wegen zu unterscheiden, die den Zustand verändern, ohne die Chemie zu ändern.
Die wichtigsten Abbauwege
Hydrolyse spaltet die Peptidbindung selbst, beschleunigt durch Wasser, Wärme und extreme pH-Werte; Asp-Pro-Sequenzen sind besonders labil. Deamidierung wandelt Asparagin oder Glutamin über ein Succinimid-Intermediat in ihre Säureformen um, fügt 1 Da hinzu und erzeugt oft ein Isoaspartat, das die Konformation verändert; Asn-Gly-Motive sind der klassische Hotspot. Oxidation fügt an Methionin, Cystein oder Tryptophan 16 Da pro Sauerstoffatom hinzu. Disulfid-Scrambling mischt die Cysteinpaarungen in zyklisierten Sequenzen neu. Physikalisch treibt Aggregation lösliche Ketten zu Oligomeren und sichtbaren Partikeln, und Adsorption entzieht Peptid einfach an die Behälterwände.
Warum das wichtig ist
Jeder Weg hat eine Signatur. Die HPLC zeigt neue Peaks oder einen verschobenen Hauptpeak, während die Massenspektrometrie die verräterische Massenverschiebung zeigt — plus 16 bei Oxidation, plus 1 bei Deamidierung, eine geringere Masse bei Spaltung. Eine abgebaute Charge kann dennoch einwandfrei aussehen, weshalb Lagerbedingungen und ein aktuelles Analysenzertifikat mehr Gewicht haben als das Aussehen. Siehe den Leitfaden zur Lagerung.
Verwandte Begriffe
Stabilität · Einfrieren und Auftauen