Amide (C-terminale amidering)

C-terminale amidering zet het vrije carbonzuur aan het einde van een peptideketen om in een primair amide, genoteerd als –CONH2 of als een afsluitende "-NH2" in een sequentieregel. Ze verwijdert één negatieve lading en verlaagt de massa van het molecuul met ongeveer 0,98 Da ten opzichte van de vrije-zuurvorm. Ze bootst een echte posttranslationele modificatie na, die in cellen wordt uitgevoerd door peptidylglycine-alfa-amiderend mono-oxygenase dat op een C-terminale glycine werkt.

Waar geamideerde peptiden voorkomen

Veel natieve signaalpeptiden zijn geamideerd en verliezen zonder amidering het grootste deel van hun receptoractiviteit — waaronder oxytocine, gastrine, calcitonine, PACAP en de groeihormoonafgevende peptiden. Onderzoeksanalogen volgen dat voorbeeld: Ipamorelin, GHRP-2 en GHRP-6 worden als C-terminale amiden geleverd, en producten zoals N-Acetyl Semax Amidate combineren amidering met N-terminale acetylering. Catalogusnamen geven het meestal expliciet aan met "amide" of "amidate".

Waarom het ertoe doet

Twee praktische gevolgen. Amidering blokkeert afknippen door carboxypeptidasen, zodat geamideerde analogen doorgaans een langere in-vitrohalfwaardetijd hebben dan hun vrije zuren. En ze verandert het doelgetal bij identiteitstests: een resultaat uit massaspectrometrie moet worden vergeleken met het theoretische molecuulgewicht van de geamideerde vorm, anders lijkt het lot 1 Da te laag. Als de sequentieregel van een leverancier en het MS-cijfer het oneens zijn over amidering, beschouw de identiteit op het analysecertificaat dan als onbevestigd.

Gerelateerde termen

peptidebinding · Ipamorelin.