Peptide linéaire

Un peptide linéaire est une chaîne non ramifiée d’acides aminés reliés par des liaisons peptidiques, portant une extrémité N-terminale libre d’un côté et une extrémité C-terminale libre de l’autre, sans fermeture de cycle covalente. La grande majorité des peptides de recherche entrent dans cette catégorie, notamment le BPC-157, l’ipamoréline, les analogues de la GHRH et la famille des incrétines.

Pourquoi la structure linéaire compte dans la recherche sur les peptides

Les avantages sont d’ordre pratique. Les séquences linéaires sont le produit naturel de la synthèse en phase solide, sans étape de cyclisation supplémentaire : les rendements sont plus élevés et le coût par milligramme plus faible ; la caractérisation est plus simple, car la masse et le temps de rétention suffisent largement, ensemble, à établir l’identité sans questions de connectivité.

Le prix à payer est l’exposition. Les extrémités libres sont des substrats pour les aminopeptidases et les carboxypeptidases, et une chaîne non contrainte explore de nombreuses conformations, si bien que l’affinité intrinsèque est souvent inférieure à celle d’un équivalent contraint. C’est pourquoi les peptides linéaires sont si souvent le point de départ d’une modification plutôt que le point d’arrivée : l’acétylation N-terminale et l’amidation C-terminale coiffent les extrémités, tandis que la PEGylation et le DAC ralentissent l’élimination. À comparer avec l’entrée peptide cyclique ; voir comment les séquences sont écrites.

Termes associés

séquence native · analogue