Glossaire
Synthèse peptidique en phase solide (SPPS)
La SPPS assemble un peptide sur résine, C-terminal en premier, un cycle déprotection-couplage par résidu. Pourquoi le couplage plafonne la pureté.
La synthèse peptidique en phase solide est la méthode introduite par Bruce Merrifield en 1963, qui lui a valu le prix Nobel de chimie 1984. La chaîne est ancrée par son extrémité C-terminale à une bille de polymère insoluble, puis allongée vers l’extrémité N-terminale. Chaque résidu requiert un cycle de déprotection, de couplage avec un acide aminé activé et protégé sur sa chaîne latérale, puis de lavage — la chaîne en croissance étant immobilisée, les réactifs en excès sont simplement éliminés par rinçage au lieu d’être séparés par chromatographie.
Pourquoi la SPPS est importante dans la recherche sur les peptides
Le rendement de couplage fixe le plafond de pureté atteignable, et l’arithmétique est impitoyable. À 99 % par étape, un peptide de 30 résidus donne environ 74 % de produit pleine longueur ; à 98 %, seulement 55 %. Tout le reste est constitué de séquences de délétion et de troncature qui doivent être éliminées par HPLC préparative, ce qui explique pourquoi les peptides plus longs coûtent disproportionnellement plus cher au milligramme et pourquoi la synthèse chimique cède la place à l’expression recombinante au-delà d’environ 50 résidus.
La pratique moderne utilise la chimie Fmoc avec déprotection à la pipéridine et clivage dans l’acide trifluoroacétique, raison pour laquelle les peptides se retrouvent sous forme de sel de TFA sauf échange ultérieur. Les séquences difficiles comportant des segments sujets à l’agrégation font chuter le rendement. Voir peptides synthétiques et la pureté HPLC expliquée.
Termes associés
groupe protecteur · pureté · liaison peptidique